GENÉTICA MOLECULAR AVANZADA

3 Créditos teóricos

Curso 1996/1997

OBJETIVOS

Desarrollo de algunos temas de actualidad relativos a la Genética Molecular. Análisis de la metodología molecular aplicada al estudio de la organización del genoma basada en los proyectos genoma.. Reorganización del genoma .Utilización de las mutaciones en el análisis genético.

PROGRAMA

TEMA 1. Proyectos genoma: Introducción. Objetivos generales. Metodologías a desarrollar. Debate inicial.

TEMA 2. Organismos modelo. Características genéticas y biológicas de las especies tomadas como modelo. Especies vegetales y animales de interés económico.

TEMA 3. Utilización de las mutaciones en el análisis genético. Marcadores moleculares. Polimorfismos de restricción, mini- y microsatélites. STSs. Métodos, en cada caso, de detección. Métodos de obtención de nuevos marcadores.

TEMA 4. Mapas genéticos: obtención. Aproximaciones clásica y molecular. Estrategias a seguir en especies concretas.

TEMA 5. Mapas físicos . Mapas citológicos, de restricción, de híbridos por radiación, Métodos, en cada caso, de construcción y utilización. Limites de resolución. Mapas de "contigs". Estrategias a seguir para su obtención. Utilización de genotecas de YACs y cósmidos.

TEMA 6. Secuenciación del DNA. Secuenciación a gran escala: nuevas metodologías.Estrategias concretas seguidas en la secuenciación de las diversas especies modelo. Perspectivas futuras.

TEMA 7. Estado actual de Proyectos genoma en procariotas. Aproximación a la estructura del genoma en H. influenzae, M. vaginalis, E. coli, etc. Análisis comparativo de los distintos genomas.

TEMA 8. Estado actual de Proyectos genoma en eucariotas. Aproximación a la estructura del genoma en levadura , C. elegans, Drosophila y el genoma humano. Análisis comparativo de los distintos genomas.

TEMA 9. Consecuencias. Impacto científico y social de los Proyectos genoma.

TEMA 10. Reorganización del genoma y función génica. Papel de la reorganización del genoma en el control de la expresión génica: ejemplos. Reorganización y creación de nuevos genes. Reorganización del genoma durante el desarrollo.

TEMA 11. Análisis molecular del "gen del año".

BIBLIOGRAFIA

ANAND, R. (1992). Yeast artificial chromosomes (YACs) and the analysis of complex genomes. TIBTECH 10: 35-40.

ANTONORAKIS, S.E. (1993). Human chromosome 21: genome mapping ans exploration circa. TIG 9: 1421-1428.

ARMOUR,.L. y A.J. JEFFREYS (1992). Biology and applications of human minisatellite loci. 2: 850-856.

BARKER, S. (1996). Genome laboratory makes its mark. Nature 379: 761.

BELLANNÉ-CHANTELOT, C. et al. (1992). Mapping the whole human genome by finger printing yeast artificial chromosomes. Cell 70: 1059-1068.

BERG, P. y MAXINE, F.S. (1995). The recombinant DNA controversy: twenty years later. PNAS 92: 9011-9013.

BOGUSKI, M.S. (1995). The turning point in genome research. TIBS20: 296-296.

BUCKLER, A. J. et al. (1991). Exon amplification: a strategy to isolate mammalian genes based on RNA splicing. PNAS 88: 4005-4009.

BURKE, D.T. et al. (1987). Cloning of large segments of exogenous DNA into yeast by menas of artificial chromosomes vectors. Science 236: 806-812.

CANTOR, C.R. (1992). Budgeting the genome. TIBTECH 10: 6-8.

COHEN, D (1993). A first generation physical map of the human genome. Nature 366: 698-701.

COLLINS, F.S. (1995). Ahead of schedule and under budget: the genome project passes its fith birthday. PNAS 92: 10821-10823.

COULSON, A., SULSTON, J., BRENNER,S. y KARN, J. (1986). Towad a phisical map of the genome of nemaotde C. elegans. Proc. Natl. Acad. Sci. 83: 7821-7825.

COX, D.R. et al. (1990). Radiation hydrid mapping: a somatic cell- genetic methods for constructing high-resollution maps of mammalian chromosomes. Science 245: 245-250.

COX, D.R. et al. (1994). Assessing mapping progress in the human genome project. Science 265: 2031- 2030.

CHUMAKOV, I. et al. (1992). Continuum of overlapping clones spanning the entire human chromosomes 21q. Nature 359: 380-387.

DIB, C. et al. (1996). A comprenehensive genetic map of the human genome based on 5,264 microsatellites. Nature 380: 152-154.

DIETRICH,W.F. et al. (1995). Mapping the mouse genome: current status and future prospects. PNAS 92: 10849-10853.

DIETRICH, W.F. et al. (1996). A comprenehensive genetic map of the mouse genome. Nature 380: 149-151.

FLEISCHMANN, R.D. et al. (1995). Whole- genome random sequencing and assmbly of H. influenzae Rd. Science 269: 496511.

GOODMAN, H.M., y J. R. ECKERS y C. DEAN (1995: The genome of Arabidopsis thaliana. PNAS 92: 10831-10835.

GOSSEN, J. y VIJG, J. (1993). Transgenic mice as model systems for studying gene mutations in vitro. TIG 9: 27-31.

GUYER, M.S. y COLLINS, F.S. (1995). How is the human genome proyect doing, and what have we laerned so far?. Proc. Natl. Acad. Sci. 92: 10841-10848.

HODGKIN ;J. et al. (1995). The nematode C. elegans and its genome. Science 270: 410-414.

GYAPAY, G. et. al. (1994). The 1993-1994 Généthon human genetic linkage map. Nature Genetics 7: 246-291.

JORDAN, E., y COLLINS, F.S. (1996). A march of genetic maps. Nature 380: 111-112.

KARLIN, S. y BURGE, CH. (1995). Dinucleotide relative abundance extremes: a genomic signature. TIG 11: 283-290.

KNOPPERS, B.M. y CHADWICK, R. (1994). The huiman genome project: under an international ethical microscope. Science 265: 2035-2036.

KORENBERG, J.R. et al (1992). Using fluorescence in situ hybridization (FISH) in genome mapping. TIBTECH 10: 27-32.

JEFFREYS, A.J., NEUMANN, R. y WILSON, V. (1990). Repeat unit sequence.... Cell 60: 473-485.

JEFFREYS, A.J., WILSON, V. y THEIN, S.L. (1985). Hypervariable minisatellite regions in human DNA. Nature 314: 67-73.

JORDAN, B.R. (1994). Genome programmes: an opportunity for biology. Biomed. Pharma. 48: 183-190.

KOHARA, Y. et al. (1987). The physical map of the whole E. coli chromosome: application of a new strategy for rapid analysis and sorting of a large genomic library. Cell 50: 495-508.

LENNON, G.G. y LEHRACH, H. (1991). Hybridization analyses of arryed cDNA libraries. TIG 7: 314-317.

LOVETT, M. et al. (1991). Direct selecyion: a method for the isolation of cDNAs encoded by large genomic regions. PNAS 88: 9628-9632.

MARSHALL, E. (1995). A strategy for sequencing the genome 5 years early. Science 267: 783-784.

MURRAY, J.C. et.al. (1994). A comprenshive human linkage map with centimorgan density. Science 265: 2049-2054.

NELSON, D.L. (1991). Applications of pomymerase chain reaction methods in genome mapping. Current Biology. 1: 62-68

NOWAK, R. (1995). bacterial genome sequence bagged. Science 269: 468-470.

NOWAK, R. (1995). Entering the pstgenome era. Science 270: 368-371.

OLIVER, S. (1995). The size is important, but... Nature Genetics 10: 253.256.

OLSON,M. et al. (1987). A common language fro physical mapping of the human genome. Science 245: 14134-1435.

OLSON, M.V. (1995). A time to sequence. Science 270: 394-396.

OLSON, M:V. et al. (1996). Random-cloning strategy for genomic restriction in yeast . PNAS 83: 7826-7830.

PARIMOTO, S., et al. (1991). cDNA selection: efficient PCR approach for the selection of cDNAs encoded in large chromosomal DNA fragments. PNAS.88: 9623-9627.

ROBINSON, C. (1992). The genome race in od the road. TIBTECH 10: 1-5.

ROSENTHAL, A. (1992). PCR amplification techniques for chromosome walking. TIBTECH 10: 44-48.

SCHLESINGER, D. (1990). Yeast artificial chromosomes: tolls for mapping and analysis of complex genomes. TIG 6: 248-258.

SCHLESINGER, D. (1995). Genome sequencing projects. Nature Medicine 1: 866-868.

SCHMIDT, R. et al. (1995). Physical map and organization of Arabidopsis thaliana chromosome 4. Science 270: 480-483.

SMITH, H.O. et al. 81995). Frequency and distribution of DNA uptake signal sequences in the H. influenzae Rd genome. Science 269: 538-5

STEPHENS, J.C. et al. (1990). Mapping the human genome: current status. Science 250: 237-250.

TUNNACLIFFE, A. et al.. (1984). Mapping the human genome by somatic cell genetics. TIBS 1: 5-7

VENTER, J.C. et al. (1992). Genome sequence analysis: scientific objetives and practical strategies. TIBTECH 10: 8-11.

VENTER, C. (1995). Homing in on the human genome. Science 269: 469.

VENTER, C. et al. (1996). More Haemophilus and Mycoplasma genes. Science 271: 1302-1304.

VELCULESCU, V.E. et al. (1995). Serail analysis of gene extression. Science 270: 484-487.

VASSAROTTI, A. y GOFFEAU, A-. (1992) Sequencing the yest genome: the European effort. TIBTECH 10: 15-18

WALTER, M.A. et al. (1993). Radiation hybrids: irradiation and fusion gene transfer. TIG 9: 352-356.

WATERTSTON, R. y SULSTON, J. (1995). The genome of C. elegans. Proc. Natl. Acad. Sci. 92: 10836-10840.

WATSON, J.D. (1990). The human genome project: past, present, and future. Science 248: 44-48.

WICKING, C., y WILLIAMSON, B. (1991). from linked marker to gene. TIG 7: 288-293.

WILSON, R. et al. (1994). 2.2. Mb of contiguous nucleotide sequence from chromosome III of C. elegans. Nature 368: 32-38.

NORMAS DE EVALUACION

Al final del cuatrimestre se realizará un examen final.